現在使用可能な酵素としては
各社Taq polymerase、AmpliTaqGold(ABI,Reaction bufferII使用のこと)、
Ex-Taq(Takara)、Pwo(Roche)、Platinum Taq High Fidelity(Invitrogen)など
このうち増幅のいいもの、正確性の高いものはPlatinum Taq High Fidelity