# mapplot からの出力例
 
 制限酵素切断部位を見るのに便利です。


 


# dotplot からの出力例

 2つの配列のどこが似ているかを見るのに便利で、似ている場所に点を打ってくれます。下図は、塩基配列の相同性を見たものですが、タンパクの配列でも解析できます。
 


# plotstructure からの出力例

 アミノ酸配列をもとに、Chou-Fasman法などで立体構造を予測し、Hydrophilicity, Surface probability, Flexibility, Antigenic index などを表示してくれます。 下図は、2-dimensional (squiggly) plot したものです。
 



# plotfold からの出力例

 DNA配列、RNA配列をもとに、Zuker法によりRNA分子の2次構造を予測し表示してくれます。 下図は、2-dimensional (squiggly) plot したものです。


 


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Last update:03/07/2006