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素粒子、原子核、宇宙線、宇宙物理にする実験
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大気水圏科学
地球人間圏科学
固体地球科学
地球生命科学
その他
Researchmap
> 医学部
医学部
研究者リスト
>>
国田 勝行
編集
国田 勝行
研究者氏名
国田 勝行
URL
https://sites.google.com/view/kkunidalab
所属
藤田医科大学
部署
医学部 情報生命科学
職名
准教授
学位
博士(医学)(京都大学)
その他の所属
奈良先端科学技術大学院大学 バイオサイエンス領域
J-Global ID
201701001948114655
プロフィール
細胞機能(移動、増殖、神経分化、物質生産)を制御している分子ネットワーク(タンパク質修飾、遺伝子発現、代謝変動など)のデータ解析と数理モデリングの研究を行っています。分子データのドメイン情報を活用して、データ駆動で分子ネットワークの数理モデルを構築する方法を開発しています(データ駆動型モデリング)。数理モデルを用いた分子ネットワークの未来予測・最適制御の研究にも取り組んでいます(モデルベースト制御)。
研究分野
情報通信 / 生命、健康、医療情報学 /
ライフサイエンス / 細胞生物学 /
ライフサイエンス / システムゲノム科学 /
ライフサイエンス / 医化学 /
研究キーワード
システム生物学
,
細胞生物学
,
データ科学
,
数理モデリング
,
シミュレーション
,
システム同定
,
最適制御
,
細胞運動、細胞増殖、神経分化
,
シグナル伝達、遺伝子発現、代謝変動
,
有用物質生産
,
画像解析
,
生細胞イメージング
,
マイクロ流体デバイス
経歴
2024年4月
-
現在
藤田医科大学 精神・神経病態解明センター 計算科学部門(兼) 准教授
2024年4月
-
現在
藤田医科大学 医学部 情報生命科学 准教授
2021年4月
-
現在
奈良先端科学技術大学院大学 バイオサイエンス領域 客員准教授
もっとみる
論文
1
2
3
4
5
>
Analysis of cytokine profiles in pediatric fulminant myocarditis and acute myocarditis multicenter study
Yoji Nomura   Takanori Suzuki   Katsuyuki Kunida   Hidetoshi Uchida   Ryoichi Ito   Yasunori Oshima   Machiko Kito   Yuki Imai   Satoru Kawai   Kei Kozawa   Kazuyoshi Saito   Tadayoshi Hata   Junichiro Yoshimoto   Tetsushi Yoshikawa   Kazushi Yasuda   
Pediatric Cardiology 2024年3月
[査読有り]
On-Line Reoptimization of Mammalian Fed-Batch Culture Using a Nonlinear Model Predictive Controller
Tomoki Ohkubo   Yuichi Sakumura   Katsuyuki Kunida   
New Generation Computing 2023年11月
[査読有り]
Extracting quantitative relationships between cell motility and molecular activities: analytical approaches and implications
Yuichi Sakumura   Katsuyuki Kunida   
Journal of Biomechanical Science and Engineering 18(4) 23-00336 2023年10月
[査読有り]
A hybrid in silico/in-cell controller for microbial bioprocesses with process-model mismatch
Tomoki Ohkubo   Yuki Soma   Yuichi Sakumura   Taizo Hanai   Katsuyuki Kunida   
Scientific Reports 13(1) 2023年9月
[査読有り]
Design of Optimal Control Input in Glycolytic Oscillation System
Tomohiro Kinugasa   Masaaki Nagahara   Yuichi Sakumura   Katsuyuki Kunida   
Proceedings of IFAC World Congress 2023 2023年7月
[査読有り]
MISC
1
2
>
Designing a hybrid in silico/in-cell controller robust to process-model mismatch associated with dynamically regulated enzyme overexpression
Tomoki Ohkubo   Yuichi Sakumura   Fuzhong Zhang   Katsuyuki Kunida   
bioRxiv 2024年2月
Development of a microfluidic cell culture and monitoring system for intracellular signaling studies
Tomoki Ohkubo   Haruyuki Kinoshita   Toshiro Maekawa   Katsuyuki Kunida   Hiroshi Kimura   Shinya Kuroda   Teruo Fujii   
bioRxiv 2018年10月
システム同定に基づく細胞内シグナル伝達機構の解明
小西克巳   藤井雅史   国田勝行   宇田新介   黒田真也   
「システム/制御/情報」 61(7) 259-264 2017年
細胞応答計測のためのマイクロ流体制御技術と細胞培養システム
木下晴之   前川敏郎   国田勝行   黒田真也   藤井輝夫   
「システム/制御/情報」 61(7) 2017年
不等間隔サンプリングデータによるシステム同定のための繰り返し核ノルム最小化法
小西 克巳   土屋 貴穂   国田 勝行   藤井 雅史   宇田 新介   黒田 真也   
システム制御情報学会研究発表講演会講演論文集 60 6p 2016年5月
講演・口頭発表等
1
2
3
4
5
>
Model selection algorithm for metabolite-enzyme networks including allosteric feedback
Tomohiro Kinugasa   Katsuyuki Yugi   Yuichi Sakumura   Katsuyuki Kunida   
EMBL Symposium AI and biology (EMBL Heidelberg)
Integrated analysis for identifying the network controllability of intracellular molecular signaling
Takeru Murayama   Yuichi Sakumura   Katsuyuki Kunida   
EMBL Symposium AI and biology (EMBL Heidelberg)
アロステリックフィードバックを含む代謝物-酵素間ネットワーク推定のためのモデル選択アルゴリズム
衣笠 智裕   柚木 克之   作村 諭一   国田 勝行   
情報処理学会 第77回バイオ情報学研究会(北陸先端科学技術大学院大学) 2024年3月7日
最適制御と特徴選択による細胞内分子ネットワークモデルの可制御性要因の探索
村山 毅   作村 諭一   国田 勝行   
情報処理学会 第77回バイオ情報学研究会(北陸先端科学技術大学院大学) 2024年3月7日
Development of a data-driven method for estimating metabolite-enzyme networks
Tomohiro Kinugasa   Katsuyuki Yugi   Yuichi Sakumura   Katsuyuki Kunida   
APSIPA Japan Chapter Workshop 2023 (Kitami Institute of Technology) 2023年9月20日
産業財産権
特願2017-242177 : 時系列画像を用いた多核で細長い細胞の自動的細胞認識法
黒田真也 井上晴幾 国田勝行
受賞
2019年11月
Asia-Pacific Signal and Information Processing Association Annual Summit and Conference (APSIPA ASC) 2019, Best Special Session Paper AwardY. Sakumura and K. Kunida
2009年10月
第82回 日本生化学会大会, 一般口答発表 優秀プレゼンテーション賞国田 勝行
委員歴
1
2
>
2024年
-
現在
日本細胞生物学会 代議員
2024年
-
現在
情報処理学会 数理モデル化と問題解決(MPS)研究会 運営委員
2021年
-
現在
藤田医大 医学部 指導教員
2021年
-
現在
藤田医大 医学部 広報委員会委員
2017年
-
現在
Faculty of 1000 Associate Faculty Member
担当経験のある科目(授業)
2023年
-
現在
データサイエンスによる生物学 (奈良先端大)
2023年
-
現在
PBLⅠ&Ⅱ(藤田医大)
2022年
-
現在
アセンブリⅢ (藤田医大)
2022年
-
現在
読書ゼミナール (藤田医大)
2021年
-
現在
基礎データサイエンス (藤田医大)
もっとみる
所属学協会
定量生物学の会
日本分子生物学会
日本細胞生物学会
日本生物物理学会
情報処理学会
共同研究・競争的資金等の研究課題
1
2
>
癌細胞における細胞極性関連因子RhoGEF の機能解析
北海道大学遺伝子病制御研究所: 一般共同研究国田 勝行 
研究期間: 2024年4月 - 2025年3月
協調的な分子情報と力で駆動する細胞運動プロセスのデータ同化予測
文部科学省: 科学研究費補助金 若手研究(生命、健康および医療情報学関連)国田 勝行 
研究期間: 2019年4月 - 2023年3月
計測・解析・制御が融合したデータ駆動型細胞制御システムの開発
NAIST: 次世代融合領域研究推進プロジェクト国田 勝行 
研究期間: 2019年6月 - 2021年3月
細胞システムの最適制御アルゴリズム創出に向けた課題調査
JST: 未来社会創造事業 特定課題調査
研究期間: 2019年11月 - 2020年3月
骨格筋におけるインスリンシグナル伝達経路の選択的制御機構の解明
文部科学省: 科学研究費補助金 若手研究B(医化学一般)国田 勝行 
研究期間: 2016年4月 - 2019年3月
メディア報道
Proof-of-concept method advances bioprocess engineering for a smoother transition to biofuels
AAAS(American Association for the Advancement of Science) EurekAlert! 2023年10月 [インターネットメディア]
Overcoming Process/Model Mismatches
Mary Ann Liebert, Inc. Genetic Engineering & Biotechnology News (GEN) 2023年10月 [新聞・雑誌]
微生物とコンピュータが協力するハイブリッドなバイオプロセス制御システムを開発
日本の研究.com 2023年9月 [インターネットメディア]
Miracle math determines the dynamically coordinated regulation of edge velocity by Rho GTPases
AAAS(American Association for the Advancement of Science) EurekAlert! 2023年3月 [インターネットメディア]
細胞の変形・運動に複数のタンパク質が協調して関わる仕組みを数式で解明
日本の研究.com 2023年2月 [インターネットメディア]
その他
研究ニーズ
特になし
研究シーズ
特になし
Fujita Health University
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