医学部
プロフィール 細胞機能(移動、増殖、神経分化、物質生産)を制御している分子ネットワーク(タンパク質修飾、遺伝子発現、代謝変動など)のデータ解析と数理モデリングの研究を行っています。分子データのドメイン情報を活用して、データ駆動で分子ネットワークの数理モデルを構築する方法を開発しています(データ駆動型モデリング)。数理モデルを用いた分子ネットワークの未来予測・最適制御の研究にも取り組んでいます(モデルベースト制御)。
研究分野
情報通信 / 生命、健康、医療情報学 /
ライフサイエンス / 細胞生物学 /
ライフサイエンス / システムゲノム科学 /
ライフサイエンス / 医化学 /
研究キーワード
システム生物学
,細胞生物学
,データ科学
,数理モデリング
,シミュレーション
,システム同定
,最適制御
,細胞運動、細胞増殖、神経分化
,シグナル伝達、遺伝子発現、代謝変動
,有用物質生産
,画像解析
,生細胞イメージング
,マイクロ流体デバイス
経歴
2024年4月
-
現在
藤田医科大学 精神・神経病態解明センター 計算科学部門(兼) 准教授
2024年4月
-
現在
藤田医科大学 医学部 情報生命科学 准教授
2021年4月
-
現在
奈良先端科学技術大学院大学 バイオサイエンス領域 客員准教授
論文
Katsuyuki Kunida   Toshiro Maekawa   Haruyuki Kinoshita   Teruo Fujii   Shinya Kuroda   
Proceedings of SICE Annual Conference 2018 1770-1771 2018年9月 [査読有り]
Haruki Inoue   Katsuyuki Kunida   Naoki Matsuda   Daisuke Hoshino   Takumi Wada   Hiromi Imamura   Hiroyuki Noji   Shinya Kuroda   
Cell Structure and Function 43(2) 153-169 2018年8月 [査読有り]
Katsumi Konishi   Masashi Fujii   Katsuyuki Kunida   Shinsuke Uda   Shinya Kuroda   
Proceedings of Asian Control Conference (ASCC) 2017 2018- 1428-1431 2018年2月 [査読有り]
This paper deals with an input/output signal recovery problem for nonlinear multiple-input single-output autoregressive exogenous (ARX) models with input nonlinearity, which are used in data-driven systems biology. A matrix rank minimization appro...
Takaho Tsuchiya   Masashi Fujii   Naoki Matsuda   Katsuyuki Kunida   Shinsuke Uda   Hiroyuki Kubota   Katsumi Konishi   Shinya Kuroda   
PLOS Computational Biology 13(12) 2017年12月 [査読有り]
Takanori Sano   Kentaro Kawata   Satoshi Ohno   Katsuyuki Yugi   Hiroaki Kakuda   Hiroyuki Kubota   Shinsuke Uda   Masashi Fujii   Katsuyuki Kunida   Daisuke Hoshino   Atsushi Hatano   Yuki Ito   Miharu Sato   Yutaka Suzuki   Shinya Kuroda   
Science Signaling 9(455) 112 2016年11月 [査読有り]
Secretion of insulin transiently increases after eating, resulting in a high circulating concentration. Fasting limits insulin secretion, resulting in a low concentration of insulin in the circulation. We analyzed transcriptional responses to diff...
MISC
Tomoki Ohkubo   Yuichi Sakumura   Fuzhong Zhang   Katsuyuki Kunida   
bioRxiv 2024年2月
Tomoki Ohkubo   Haruyuki Kinoshita   Toshiro Maekawa   Katsuyuki Kunida   Hiroshi Kimura   Shinya Kuroda   Teruo Fujii   
bioRxiv 2018年10月
小西克巳   藤井雅史   国田勝行   宇田新介   黒田真也   
「システム/制御/情報」 61(7) 259-264 2017年
木下晴之   前川敏郎   国田勝行   黒田真也   藤井輝夫   
「システム/制御/情報」 61(7) 2017年
小西 克巳   土屋 貴穂   国田 勝行   藤井 雅史   宇田 新介   黒田 真也   
システム制御情報学会研究発表講演会講演論文集 60 6p 2016年5月
講演・口頭発表等
Tomohiro Kinugasa   Katsuyuki Yugi   Yuichi Sakumura   Katsuyuki Kunida   
EMBL Symposium AI and biology (EMBL Heidelberg)
Takeru Murayama   Yuichi Sakumura   Katsuyuki Kunida   
EMBL Symposium AI and biology (EMBL Heidelberg)
衣笠 智裕   柚木 克之   作村 諭一   国田 勝行   
情報処理学会 第77回バイオ情報学研究会(北陸先端科学技術大学院大学) 2024年3月7日
村山 毅   作村 諭一   国田 勝行   
情報処理学会 第77回バイオ情報学研究会(北陸先端科学技術大学院大学) 2024年3月7日
Tomohiro Kinugasa   Katsuyuki Yugi   Yuichi Sakumura   Katsuyuki Kunida   
APSIPA Japan Chapter Workshop 2023 (Kitami Institute of Technology) 2023年9月20日
受賞
2019年11月
Asia-Pacific Signal and Information Processing Association Annual Summit and Conference (APSIPA ASC) 2019, Best Special Session Paper AwardY. Sakumura and K. Kunida
2009年10月
第82回 日本生化学会大会, 一般口答発表 優秀プレゼンテーション賞国田 勝行
委員歴
2024年
-
現在
情報処理学会 数理モデル化と問題解決(MPS)研究会 運営委員
2021年
-
現在
藤田医大 医学部 広報委員会委員
2017年
-
現在
Faculty of 1000 Associate Faculty Member
担当経験のある科目(授業)
2023年
-
現在
データサイエンスによる生物学 (奈良先端大)
2022年
-
現在
アセンブリⅢ (藤田医大)
2022年
-
現在
読書ゼミナール (藤田医大)
2021年
-
現在
基礎データサイエンス (藤田医大)