部門・スタッフ紹介
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センター長

貝淵 弘三 教授
1980年神戸大学医学部卒業、1984年神戸大学大学院医学研究科博士課程修了。医師、医学博士。
奈良先端科学技術大学院大学教授、名古屋大学大学院医学系研究科教授を歴任し、2019年4月より藤田医科大学医科学研究センター・センター長。精神・神経病態解明センター・センター長、オープンファシリティセンター・センター長を兼務。
専門分野は生化学、細胞生物学、薬理学、神経科学。
2011年中日文化賞、2017年紫綬褒章受章。
1980年神戸大学医学部卒業、1984年神戸大学大学院医学研究科博士課程修了。医師、医学博士。
奈良先端科学技術大学院大学教授、名古屋大学大学院医学系研究科教授を歴任し、2019年4月より藤田医科大学医科学研究センター・センター長。精神・神経病態解明センター・センター長、オープンファシリティセンター・センター長を兼務。
専門分野は生化学、細胞生物学、薬理学、神経科学。
2011年中日文化賞、2017年紫綬褒章受章。
副センター長

渡辺 宏久 教授
2023年から副センター長を拝命しました。
所属は脳神経内科学教室です。
オープンファシリティセンターは、最新鋭の解析システムを通じ、基礎研究者にとってトランスレーショナルリサーチにつながるような、臨床科医にとってはリバーストランスレーショナルリサーチにつながるような貴重な成果を得ることができる場であると思っています。この場を通じ、基礎研究者と臨床科医が良好なネットワークを構築し、従来に無い枠組の幅広い研究を世界に発信出来るような支援を目指して参ります。
2023年から副センター長を拝命しました。
所属は脳神経内科学教室です。
オープンファシリティセンターは、最新鋭の解析システムを通じ、基礎研究者にとってトランスレーショナルリサーチにつながるような、臨床科医にとってはリバーストランスレーショナルリサーチにつながるような貴重な成果を得ることができる場であると思っています。この場を通じ、基礎研究者と臨床科医が良好なネットワークを構築し、従来に無い枠組の幅広い研究を世界に発信出来るような支援を目指して参ります。

永井 拓 教授
2020年より副センター長を拝命しています。
所属は精神・神経病態解明センター(ICBS)神経行動薬理学研究部門です。
学内外の研究生産性の向上、研究における飛躍的イノベーション、魅力的な研究環境の実現を加速させて、より幅広い研究活動の支援を目指します。
2020年より副センター長を拝命しています。
所属は精神・神経病態解明センター(ICBS)神経行動薬理学研究部門です。
学内外の研究生産性の向上、研究における飛躍的イノベーション、魅力的な研究環境の実現を加速させて、より幅広い研究活動の支援を目指します。
生体画像解析室
生体画像解析室では、電子顕微鏡、共焦点レーザー顕微鏡、バーチャルスライド撮影装置など、医学研究に不可欠な先端イメージング環境を提供しています。また、電子顕微鏡・光学顕微鏡の双方に対応した最新型ミクロトーム、全自動免疫染色装置、自動包埋装置、自動染色装置などの試料作製環境を管理・運営しています。
さらに、高度な技術と幅広い解析経験を有する専門スタッフが、各種試料作製の受託と解析支援にも対応しています。
各種顕微鏡の使用方法、データ取得のポイント、試料作製プロトコルに関するご相談も、お気軽にお問い合わせください。
さらに、高度な技術と幅広い解析経験を有する専門スタッフが、各種試料作製の受託と解析支援にも対応しています。
各種顕微鏡の使用方法、データ取得のポイント、試料作製プロトコルに関するご相談も、お気軽にお問い合わせください。

高橋 泰伽 講師
研究テーマは生体イメージング技術の開発と応用。新規ナノマテリアルを用いた生体脳の超広範囲イメージング手法の開発や、人工冬眠マウスの樹状突起スパイン形態ダイナミクスのin vivo解析等に従事してきました。
光学顕微鏡を中心とした観察手法や画像解析の研究支援を担当します。
研究テーマは生体イメージング技術の開発と応用。新規ナノマテリアルを用いた生体脳の超広範囲イメージング手法の開発や、人工冬眠マウスの樹状突起スパイン形態ダイナミクスのin vivo解析等に従事してきました。
光学顕微鏡を中心とした観察手法や画像解析の研究支援を担当します。
Researchmap URL: https://researchmap.jp/tt_takahashi
| ・水口 幾久代 技術員 | 担当業務:共焦点顕微鏡・光学顕微鏡のメンテナンスおよび研究支援業務全般 |
| ・冨永 三千代 技術員 | 担当業務:免疫染色、電子顕微鏡のメンテナンスおよび研究支援業務全般 |
| ・前嶋 美香 技術員 | 担当業務:遺伝子検査用薄切、特殊染色および研究支援業務全般 |
| ・小笠原 さや香 技術員 | 担当業務:電子顕微鏡試料作製、凍結切片作製および研究支援業務全般 |
| ・武内 恒成 教授 | 担当業務:電子顕微鏡の研究支援および運営業務全般 |
細胞機能解析室
細胞機能解析室は、フローサイトメトリー(FCM)を駆使した、個々の細胞の表現型を解析する「アナリシス」から、特定の細胞を生きたまま分取する「ソーティング」に至るまでの包括的な研究を支援しています。この目的のため、当解析室では、細胞の表面や内部に発現する分子を、同時に10以上の色素で識別・定量可能な、5 機種のFCMを管理・運営・提供しています。
また、FCMに関する研究相談や技術支援、共同研究参画を通じて、若手研究者の研究力向上にも貢献しています。
また、FCMに関する研究相談や技術支援、共同研究参画を通じて、若手研究者の研究力向上にも貢献しています。

手塚 裕之 講師
東京医科歯科大学大学院医学系研究科博士課程修了
(藤田紘一郎先生、今井伸二郎先生)、博士(医学)取得。
秋田大学および東京医科歯科大学(樗木俊聡先生)にて腸管免疫の研究、
星薬科大学(成田年先生)にて脳腸相関の研究に従事。
本学では従前の研究に加え、FCMを駆使した研究推進支援や共同研究、
免疫学を中心とした講義(大学/大学院)を担当している。
東京医科歯科大学大学院医学系研究科博士課程修了
(藤田紘一郎先生、今井伸二郎先生)、博士(医学)取得。
秋田大学および東京医科歯科大学(樗木俊聡先生)にて腸管免疫の研究、
星薬科大学(成田年先生)にて脳腸相関の研究に従事。
本学では従前の研究に加え、FCMを駆使した研究推進支援や共同研究、
免疫学を中心とした講義(大学/大学院)を担当している。

入口 晴美 技術員
本学衛生技術科卒業。
総合病院にて臨床検査技師として勤務。
利用者の要望に応えられるよう努めてまいります。
本学衛生技術科卒業。
総合病院にて臨床検査技師として勤務。
利用者の要望に応えられるよう努めてまいります。

柴田 侑依 客員研究技術員
藤田医科大学卒業。
市立四日市病院 中央検査室勤務。
本学では、フローサイトメトリー等を用いた細胞の解析をおこなっております。
藤田医科大学卒業。
市立四日市病院 中央検査室勤務。
本学では、フローサイトメトリー等を用いた細胞の解析をおこなっております。
オミックス解析室
オミックス解析室では質量分析計を利用したメタボロミクス、プロテオミクス解析を行っています。メタボロミクスでは代謝物の一斉分析により、疾患に特異的なマーカー検索、代謝物の変動による病態の予測などに応用が可能です。
プロテオミクスでは、試料中のタンパク質の同定、定量、翻訳後修飾解析、相互作用分子解析等が行えます。バイオマーカー探索、創薬研究、細胞内メカニズムの解明等にご利用ください。
プロテオミクスでは、試料中のタンパク質の同定、定量、翻訳後修飾解析、相互作用分子解析等が行えます。バイオマーカー探索、創薬研究、細胞内メカニズムの解明等にご利用ください。

前田 康博 准教授
メタボロミクス解析を担当しています。
高速液体クロマトグラフ-タンデム質量分析計(LC-MS/MS)を利用し、一時代謝物の網羅的解析をおこなっています。その他リン脂質や特定化合物の定量などを行っています。
メタボロミクス解析を担当しています。
高速液体クロマトグラフ-タンデム質量分析計(LC-MS/MS)を利用し、一時代謝物の網羅的解析をおこなっています。その他リン脂質や特定化合物の定量などを行っています。

西岡 朋生 講師
プロテオミクス解析の支援業務を担当しています。
兼任する医科学研究センターではリン酸化プロテオミクス研究、生化学的な研究を行っております。
実験の開始から解析法までお気軽に相談いただければと思います。
プロテオミクス解析の支援業務を担当しています。
兼任する医科学研究センターではリン酸化プロテオミクス研究、生化学的な研究を行っております。
実験の開始から解析法までお気軽に相談いただければと思います。

田中 美帆 助手
質量分析装置OrbiTrapFusionの管理とプロテオミクス受託解析を行っております。
依頼者の多様な要望に応えられるよう心がけています。
質量分析装置OrbiTrapFusionの管理とプロテオミクス受託解析を行っております。
依頼者の多様な要望に応えられるよう心がけています。
タンパク質・遺伝子解析室
タンパク質・遺伝子解析室では、主にタンパク質解析や遺伝子解析の支援を行っております。サンガーシーケンサーによるDNAシーケンスの受託解析を実施しておりますので、ぜひご活用ください。また、リアルタイムPCR装置や超遠心機などの管理を担当しております。
実験や解析、装置の使用方法に関するご相談がございましたら、お気軽にお問い合わせください。
利用者の皆様の研究の進展に少しでも貢献できるよう、支援に努めてまいります。
実験や解析、装置の使用方法に関するご相談がございましたら、お気軽にお問い合わせください。
利用者の皆様の研究の進展に少しでも貢献できるよう、支援に努めてまいります。

塚本 健太郎 講師
専門は比較免疫生物学で、博士(理学)を取得しています。
脊椎動物(主に硬骨魚類)を対象に、免疫系遺伝子の分子進化および機能進化に関する研究を行っています。
また、第一種放射線取扱主任者として、RI利用施設の管理業務にも従事し、安全管理にも取り組んでいます。
専門は比較免疫生物学で、博士(理学)を取得しています。
脊椎動物(主に硬骨魚類)を対象に、免疫系遺伝子の分子進化および機能進化に関する研究を行っています。
また、第一種放射線取扱主任者として、RI利用施設の管理業務にも従事し、安全管理にも取り組んでいます。
| ・萬 由美子 技術員 |
ゲノム解析室
ゲノム解析室では、次世代シーケンサーを用いた研究の普及と支援を目的として、NextSeq 2000による全エクソンシーケンス、RNAシーケンス、シングルセルRNAシーケンスの受託解析を実施しております。加えて、研究者の多様なニーズに対応するため、エピゲノム解析やナノポアシーケンサーによるロングリード解析にも対応しております。
受託解析のご依頼やゲノム解析研究に関するご相談を随時受け付けておりますので、お気軽にお問い合わせください。
受託解析のご依頼やゲノム解析研究に関するご相談を随時受け付けておりますので、お気軽にお問い合わせください。

杉原 英志 准教授
筑波大学大学院博士課程卒(医学博士)。専門は腫瘍生物学。
大学院時代はがんの細胞周期異常の研究、慶應義塾大学では発がんマウスモデルの構築とがん悪性化機構の解析に従事した。筑波大学プレシジョンメディスン開発研究センターにて大規模ゲノム解析プラットフォームの構築を主導した。
現在は、ゲノム、エピゲノム、トランスクリプトーム解析の基盤構築と、それを基にした難治性がんの治療抵抗性メカニズムの解明に取り組んでいる。
筑波大学大学院博士課程卒(医学博士)。専門は腫瘍生物学。
大学院時代はがんの細胞周期異常の研究、慶應義塾大学では発がんマウスモデルの構築とがん悪性化機構の解析に従事した。筑波大学プレシジョンメディスン開発研究センターにて大規模ゲノム解析プラットフォームの構築を主導した。
現在は、ゲノム、エピゲノム、トランスクリプトーム解析の基盤構築と、それを基にした難治性がんの治療抵抗性メカニズムの解明に取り組んでいる。
| ・秦 優子 技術員 |
RI利用施設
RI利用施設では、RI(放射性同位元素)を用いた実験・研究の管理支援を行っております。安全管理体制のもと、放射線業務従事者の登録、各種放射線測定器や実験設備の提供、利用手続きのサポートを実施しています。
当施設の利用に関するご相談がございましたら、お気軽にお問い合わせください。
(現在、施設の利用に一部制限がございますので、ご利用を希望される場合は事前に担当者までご連絡ください。)
当施設の利用に関するご相談がございましたら、お気軽にお問い合わせください。
(現在、施設の利用に一部制限がございますので、ご利用を希望される場合は事前に担当者までご連絡ください。)

林 直樹 教授
医療科学部臨床教育連携ユニット 医学物理学分野
名古屋大学大学院医学系研究科博士課程修了。博士(医療技術学)。
医学物理士、第一種放射線取扱主任者。
正確で安全な医療の実現のために藤田医科大学病院や関連医療施設において主に放射線治療領域の医学物理学的研究を実施している。
医学物理学会理事、医学物理士認定機構理事、国際医学物理機構(IOMP)教育委員、アジアオセアニア医学物理機構(AOCMP)学術委員、米国医学物理学会正会員、欧州放射線腫瘍学会正会員。
医療科学部臨床教育連携ユニット 医学物理学分野
名古屋大学大学院医学系研究科博士課程修了。博士(医療技術学)。
医学物理士、第一種放射線取扱主任者。
正確で安全な医療の実現のために藤田医科大学病院や関連医療施設において主に放射線治療領域の医学物理学的研究を実施している。
医学物理学会理事、医学物理士認定機構理事、国際医学物理機構(IOMP)教育委員、アジアオセアニア医学物理機構(AOCMP)学術委員、米国医学物理学会正会員、欧州放射線腫瘍学会正会員。
Researchmap URL: https://researchmap.jp/nahayashi
| ・塚本 健太郎 講師 (タンパク質・遺伝子解析室と兼任) |
第一種放射線取扱主任者 |
創薬科学研究室
当研究室(1号館315)では、FDSS/μCELL を用いた化合物の初期スクリーニングを実施しています。
本装置は、薬剤分注時におけるサンプルの蛍光や発光の時間変化を、全ウェル同時に測定・解析することが可能です。96/384 well plate に対応しており、ハイスループット系の構築にもご利用いただけます。
また、Thermo社 Multidrop Pico-8 を備えており、最小 11 pL までの少量分注が可能です。qPCRや薬物併用試験など、微量操作を必要とする実験に最適です。
研究支援や実験系の相談も随時受け付けておりますので、どうぞお気軽にご利用ください。
本装置は、薬剤分注時におけるサンプルの蛍光や発光の時間変化を、全ウェル同時に測定・解析することが可能です。96/384 well plate に対応しており、ハイスループット系の構築にもご利用いただけます。
また、Thermo社 Multidrop Pico-8 を備えており、最小 11 pL までの少量分注が可能です。qPCRや薬物併用試験など、微量操作を必要とする実験に最適です。
研究支援や実験系の相談も随時受け付けておりますので、どうぞお気軽にご利用ください。

守口 由紀子 特任准教授
創薬ベンチャー企業においてスクリーニング部門のManagerに従事。Biologistとして低分子創薬が専門です。現在は橋渡し研究シーズ探索センターにてProject Managerを担当しています。アカデミアと企業をつなぐ橋渡し役として皆様の研究の推進を支援させていただきます。
創薬ベンチャー企業においてスクリーニング部門のManagerに従事。Biologistとして低分子創薬が専門です。現在は橋渡し研究シーズ探索センターにてProject Managerを担当しています。アカデミアと企業をつなぐ橋渡し役として皆様の研究の推進を支援させていただきます。

坪井 大輔 准教授
創薬開発に資するアッセイ系の構築支援を担当しています。
専門は分子細胞生物学であり、博士(医学)を取得しております。兼任している医科学研究センターでは精神神経疾患の分子病態研究に従事しており、幅広いウェット実験を経験しているので、アッセイの設計・最適化から活性評価まで一貫した支援に貢献ができると思います。
まずは気軽にご相談いただければと思います。
創薬開発に資するアッセイ系の構築支援を担当しています。
専門は分子細胞生物学であり、博士(医学)を取得しております。兼任している医科学研究センターでは精神神経疾患の分子病態研究に従事しており、幅広いウェット実験を経験しているので、アッセイの設計・最適化から活性評価まで一貫した支援に貢献ができると思います。
まずは気軽にご相談いただければと思います。

山本 美月 助教
ケミカルバイオロジーを専門としています。
RNAアプタマーやペプチドなどの機能性分子を扱ってきました。現在は創薬開発に向けた細胞アッセイ系の構築などの研究支援を行っています。
お気軽にご相談ください。
ケミカルバイオロジーを専門としています。
RNAアプタマーやペプチドなどの機能性分子を扱ってきました。現在は創薬開発に向けた細胞アッセイ系の構築などの研究支援を行っています。
お気軽にご相談ください。

二村 愛 主任
創薬開発部門で実験支援を担当しています。
プラスミド作製などの分子生物学実験、細胞を用いた評価試験を通じて、創薬研究に必要なデータ取得を担っています。
創薬開発部門で実験支援を担当しています。
プラスミド作製などの分子生物学実験、細胞を用いた評価試験を通じて、創薬研究に必要なデータ取得を担っています。
データ解析室
当解析室では、学内の研究データ管理のための情報インフラや研究データのレポジトリサービスの構築・運営、および、各種研究相談・支援やin silico 創薬スクリーニング受託解析を行ないます。
おもな研究相談・研究支援の例は以下の通りです。
・取得済みデータや公開データを用いた研究における統計解析、多次元データ解析
・in silico 創薬研究支援
どうぞお気軽にご利用ください。
おもな研究相談・研究支援の例は以下の通りです。
・取得済みデータや公開データを用いた研究における統計解析、多次元データ解析
・in silico 創薬研究支援
どうぞお気軽にご利用ください。

吉本 潤一郎 教授
専門分野は、ベイズ統計を中心とした機械学習アルゴリズムの開発とそのデータ解析への応用で、長年にわたり多様な医療・生命科学データを対象とした研究に従事してきました。これまでの知見を活かし、臨床・実験データの二次解析支援やオープンサイエンスの推進を通じて、研究の高度化と新たな価値創出に貢献したいと考えています。
兼任:医学部医用データ科学講座
専門分野は、ベイズ統計を中心とした機械学習アルゴリズムの開発とそのデータ解析への応用で、長年にわたり多様な医療・生命科学データを対象とした研究に従事してきました。これまでの知見を活かし、臨床・実験データの二次解析支援やオープンサイエンスの推進を通じて、研究の高度化と新たな価値創出に貢献したいと考えています。
兼任:医学部医用データ科学講座
Researchmap URL: https://researchmap.jp/jun-y

觀音 隆幸 准教授
生命科学や医療情報学の分野において、データベースやプラットフォームの開発を中心とした研究を行なっています。データ駆動型研究のための学術的な情報基盤の構築に取り組んでいます。in silico 創薬研究支援のプラットフォーム整備を通じて、学内外の基礎及び応用研究に貢献したいと考えています。
兼任:医学部 医用データ科学講座
生命科学や医療情報学の分野において、データベースやプラットフォームの開発を中心とした研究を行なっています。データ駆動型研究のための学術的な情報基盤の構築に取り組んでいます。in silico 創薬研究支援のプラットフォーム整備を通じて、学内外の基礎及び応用研究に貢献したいと考えています。
兼任:医学部 医用データ科学講座
Researchmap URL:https://researchmap.jp/kannon

嶋田 誠 講師
専門は進化医学ゲノミクスです。これまで基礎研究に従事する一方で、ゲノム情報の利活用を目的とした公開データベースの構築に携わり、データ登録受付から公開までを担う組織の一員として研究データの管理・運用に関わってきました。これらの経験を活かし、学内における研究データ管理の仕組みの構築および運用に貢献したいと考えております。
兼任:中京学院大学 非常勤講師
専門は進化医学ゲノミクスです。これまで基礎研究に従事する一方で、ゲノム情報の利活用を目的とした公開データベースの構築に携わり、データ登録受付から公開までを担う組織の一員として研究データの管理・運用に関わってきました。これらの経験を活かし、学内における研究データ管理の仕組みの構築および運用に貢献したいと考えております。
兼任:中京学院大学 非常勤講師
Researchmap URL: https://researchmap.jp/shimada-mk
構造解析室
構造解析室は創薬研究の推進を目的として、2025年4月に設置されました。
当解析室は蛋白質構造情報を基盤に、基礎研究・臨床研究・創薬研究をつなぐハブとなることを目指しています。
依頼のあった蛋白質試料の調製や計算機を用いたシミュレーション解析を行っており、必要に応じて大阪大学蛋白質研究所の超高磁場NMR施設も活用しています。
蛋白質構造情報の解釈や解析戦略の立案などについても、お気軽にご相談ください。
一例として、2025年度URA室主催の研究マッチングフォーラムにおけるポスター発表を契機に、臨床研究医(須藤湧太先生、中島葉子先生:小児科)との連携が生まれました。本連携では、疾患原因遺伝子の新規変異について、AlphaFoldを用いた蛋白質構造の可視化と機能影響の考察を行うなど、基礎・臨床をつなぐ構造解析支援を実施しています。
当解析室は蛋白質構造情報を基盤に、基礎研究・臨床研究・創薬研究をつなぐハブとなることを目指しています。
依頼のあった蛋白質試料の調製や計算機を用いたシミュレーション解析を行っており、必要に応じて大阪大学蛋白質研究所の超高磁場NMR施設も活用しています。
蛋白質構造情報の解釈や解析戦略の立案などについても、お気軽にご相談ください。
一例として、2025年度URA室主催の研究マッチングフォーラムにおけるポスター発表を契機に、臨床研究医(須藤湧太先生、中島葉子先生:小児科)との連携が生まれました。本連携では、疾患原因遺伝子の新規変異について、AlphaFoldを用いた蛋白質構造の可視化と機能影響の考察を行うなど、基礎・臨床をつなぐ構造解析支援を実施しています。

赤木 謙一 特任准教授
構造生物学を専門とし、核磁気共鳴(NMR)法を主な解析手法として、溶液中における蛋白質の立体構造および動的性質の解明に取り組んでいます。これまでに、サイトカイン蛋白質やアミロイドβなどの疾患関連蛋白質を対象とした研究を行ってきました。
また、共同研究を通じて、多様な蛋白質を対象とした構造解析にも取り組んできました。加えて、NMRを基盤とした分析化学的手法として、京都大学エネルギー理工学研究所エネルギー構造生命科学研究分野と連携のもと、LC-NMR法による解析にも取り組んでいます。
兼任:大阪大学 蛋白質研究所 招へい准教授
構造生物学を専門とし、核磁気共鳴(NMR)法を主な解析手法として、溶液中における蛋白質の立体構造および動的性質の解明に取り組んでいます。これまでに、サイトカイン蛋白質やアミロイドβなどの疾患関連蛋白質を対象とした研究を行ってきました。
また、共同研究を通じて、多様な蛋白質を対象とした構造解析にも取り組んできました。加えて、NMRを基盤とした分析化学的手法として、京都大学エネルギー理工学研究所エネルギー構造生命科学研究分野と連携のもと、LC-NMR法による解析にも取り組んでいます。
兼任:大阪大学 蛋白質研究所 招へい准教授
Researchmap URL:https://researchmap.jp/nmrxem
ばんたね病院

